sexta-feira, 17 de junho de 2011

12-2011 - MO640 - Questão para a prova oral


De acordo com o texto "Efficient sorting of genomic permutations by translocation, inversion and block interchange", é possível dividir e fundir CIs para absorvê-los em um cromossomo linear através de um DCJ (double-cut-and-join) adequado. As fases realizadas para resultar o cromossomo linear são, em ordem:
  1. 0-Nivelamento de pontas, 1-Translocação, 2-Inversão e 3-Troca de blocos;
  2. 1-Translocação, 2-Inversão e 3-Troca de blocos;
  3. 0-Translocação, 1-fissão/fusão, 2-Inversão e 3-Troca de blocos ;
  4. 1-Translocação, 2-fissão/fusão e 3-Troca de blocos;
  5. NDA.

Um comentário:

  1. Acho que você se confundiu. Estes itens não são fases, mas sim elencos de operações que podem ser resolvidos com os resultados deste paper. Ao invés da DCJ, que, na época do paper, não era "tradicional" nos estudos de rearranjo, podemos pensar no elenco consistindo em translocações (peso 1), reversões (peso 1) e trocas de blocos (peso 2).

    Mas boa questão, talvez eu salve ela se der um tempinho.

    Por enquanto, fica fora.

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