De acordo com o texto "Efficient sorting of genomic permutations by translocation, inversion and block interchange", é possível dividir e fundir CIs para absorvê-los em um cromossomo linear através de um DCJ (double-cut-and-join) adequado. As fases realizadas para resultar o cromossomo linear são, em ordem:
- 0-Nivelamento de pontas, 1-Translocação, 2-Inversão e 3-Troca de blocos;
- 1-Translocação, 2-Inversão e 3-Troca de blocos;
- 0-Translocação, 1-fissão/fusão, 2-Inversão e 3-Troca de blocos ;
- 1-Translocação, 2-fissão/fusão e 3-Troca de blocos;
- NDA.
