07-2011 - MO640 - Questão para prova oral

De acordo com os papers “An Eulerian path approach to DNA fragment assembly” e “CAP3: A DNA Sequence Assembly Program”, “chimeric reads” são problemas que devem ser identificados e removidos para uma boa qualidade da montagem de fragmentos. O que são “chimeric reads”?

1. São várias regiões repetidas presentes na sequência;
2. São regiões de baixa qualidade do genoma ou contaminantes;
3. São reads de locais diferentes que se juntam e formam um novo read;
4. São contigs que são produzidos com tamanhos abaixo da métrica N50;
5. NDA.